Миризмата на изпражненията е свързана главно с гнилостни процеси, които засягат аминокиселините, избягали от чревната абсорбция. Тези хранителни вещества всъщност се прихващат от бактериите на дебелото черво, преминавайки през процес на декарбоксилиране, който произвежда следните токсични амини:
аргинин → агматин
цистин и цистеин → меркаптан
хистидин → хистамин
лизин → кадаверин
орнитин → путресцин
тирозин → тиратина
триптофан → индол и скатол
Много от тези вещества придават на изпражненията особено неприятна миризма. Изпражненията стават доста лоши, дори когато останат в червата за дълго време, както и в гореспоменатите случаи на малабсорбция (цьолиакия, панкреатична недостатъчност, чревни инфекции, болест на Crohn, улцерозен колит, синдром на късото черво, муковисцидоза, черен дроб болести и заболявания на жлъчните пътища и стомаха, придружени от хипохлорхидрия). Когато малабсорбцията е предимно протеин, миризмата на изпражненията е гадеща, докато тя става кисела и проникваща, когато в дебелото черво пристигнат големи количества неабсорбирани или лошо смилаеми захари и нишесте, след което ферментират от местната флора с производството на летливи мастни киселини .
Диарията и изпражненията на вегетарианеца имат лоша миризма.
Изпражненията с мирис на риба или сперма са характерни за бациларна дизентерия, холера и по -общо за мукорея.
В обобщение, миризмата на изпражнения следователно се влияе от хранителните навици (количество протеини, ароматни храни като чесън или лук и т.н.), от чревната бактериална флора, от здравословното състояние и от определени навици (като пушене или дъвчене) Като цяло, консумацията на малки и добре балансирани ястия, без да се свързват големи количества „несъвместими“ храни (вж. дисоциираната диета), спомага за оптимизиране на храносмилателните процеси, намалявайки честотата на нарушения като метеоризъм и метеоризъм, и дава на изпражнения с миризма на sui generis.
Всеки случай, в който лошата миризма на изпражненията е придружена от симптоми като черни, катранени или бледи изпражнения, наличие на кръв в тях, повишена температура, втрисане, тежки коремни спазми, обилно наличие на слуз в изпражненията и загуба на тегло.
